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製品情報

 NEBNext Ultra II FS DNA ライブラリー調製試薬
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わずか100 pg のDNA よりライブラリー調製が可能なイルミナNGS用DNAライブラリー調製試薬です。

製品資料()、英語テクニカルノート(

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NEBNext Ultra II FS DNA Library Prep Kit は 100 pg の DNA よりライブラリー調製ができるイルミナNGSライブラリー調製試薬です。酵素による DNA 断片化とEnd repair/dA-tailing 反応、アダプターライゲーションまでを 1 チューブで行うので、実験手順が簡単な上、Input DNA のロスがなく、100 pg の DNA より高収量でライブラリー調製をすることができます。DNA 断片化酵素はGC 含量などに依存せずに DNA を断片化する上、DNA サイズはインキュベーション時間で簡単に調整することができます。

         
特長:
わずか 100 pg DNA より、簡単プロトコールでライブラリー調製
 ・ 100 pg DNA よりライブラリー調製    ・ GC 含量、サンプルの塩濃度に依存せず、低バイアスで
  (100 pg ~ 500 ng Input DNA に対応)     DNA を断片化
         
 ・ 酵素による DNA 断片化からライブラリー調製終了まで    ・ 酵素で DNA を断片化するので、高価な機器や専用
  <3.2時間のプロトコール     チューブは不要
         
 ・ 面倒なビーズ精製は 2 回のみ、ハンズオンタイムは    ・ 物理的断片化と比較して酸化ダメージや塩基置換の
  <14分間の簡単プロトコール     リスクが低減

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高感度かつ高収量

各社のライブラリー調製試薬および断片化方法を比較した結果、NEBNext Ultra II DNA FS キットの感度と収量が最も高く、100 pg の微量 DNA からでも高収量でライブラリーを調製できることが示された。ライブラリーはヒト NA19240 ゲノム DNA より調製、Input DNA 量と PCR サイクル数は図に記載、実験作業は2 名の研究者(n=3-6)により個別に行われた。

 

 

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均一なカバレージを実現

各社のライブラリー調製試薬および断片化方法を比較した結果、NEBNext Ultra II FS キットが最も低バイアスの GC カバレージをもたらすことが示された。ライブラリーは 1 ng のゲノム DNA3 種類の微生物)より調製、イルミナ社の NGS 機器で解析した。リードはBowtie 2.2.4 によりマッピング、GC カバレージは Picards CollectGCBiasMetrics v1.117)により算出した。NEBNext Ultra II FS キットのカバレージは 3 種類の微生物ゲノム DNAGC 含量 385165%)において、1.0 付近にプロット(緑線)されており、GC バイアスが低いことが表されている。

 

 

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最小限のダメージで DNA を断片化

物理的に断片化(超音波破砕)した DNA NEBNext Ultra II FS キット(酵素的断片化)で調製したライブラリーを比較した結果、Ultra II FSキットで調製したライブラリーでは、酸化ダメージ・マーカーの塩基置換の頻度が低いことが示された。一方、物理的に断片化したDNA より調製したライブラリーでは C>A および G>Tの塩基置換が高い頻度で検出され、断片化中に DNA が酸化によりダメージを受けている可能性が示唆された。ライブラリーは 1ng および 100 ng のヒト NA19240 ゲノムDNA より調製し、イルミナ社の NGS 機器で解析した。723M のリードよりランダムに抽出されたリードを GRCh38リファレンス DNA にアライメントして解析した。

 

 

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NEBNext Ultra II FS DNA キットはインキュベーション時間を調整することにより、様々なサイズの DNA 断片を調製することができる。左図は 100 ng のヒト NA19240 ゲノム DNA を 5-40分間の反応時間で断片化し、100 bp - 1 kb の DNA を調製した例である。

 

 

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NEBNext Ultra II FS DNA キットは DNA の保存液の組成 (塩濃度など) による影響が少なく、安定したサイズの DNA を調製することができる。A 社製品による酵素的断片化は DNA の保存液の組成の影響が大きく、DNA サイズが安定しない。CS は A 社製品に付属している調整溶液を指定量添加して調製した DNA サンプルである。

 

 

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 NEBNext Ultra II FS DNA Library prep Kit for Illumina
 

特長:

・わずか 100 pg DNA よりライブラリー調製

   (100 pg - 500 ng Input DNA に対応)

・DNA 断片化からライブラリー調製終了まで

  <3.2 時間のプロトコール

・面倒なビーズ精製は 2 回のみ、ハンズオンタイムは

  <14分間の簡単プロトコール

・4,100 円 / 反応 より

製品番号 容量 希望小売価格
E7805S 24 rxns ¥ 118,000
E7805L 96 rxns ¥ 398,000
   *製品にアダプターオリゴ(下記参照)、DNA 精製ビーズは含まれていません。
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 NEBNext Ultra II FS DNA Library prep with Sample Purification Beads
 

特長:

・わずか 100 pg DNA よりライブラリー調製

   (100 pg - 500 ng Input DNA に対応)

・DNA 断片化からライブラリー調製終了まで

  <3.2 時間のプロトコール

・面倒なビーズ精製は 2 回のみ、ハンズオンタイムは

  <14分間の簡単プロトコール

・4,100 円 / 反応 より

製品番号 容量 希望小売価格
E6177S 24 rxns ¥ 132,000
E6177L  96 rxns ¥ 459,000
   *製品にはアダプターオリゴ(下記参照)含まれていません。

 

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 組み合わせにより 384 プレックス解析が可能
 
 製品名 製品番号 容量 希望価格 備考

 NEBNext Multiplex Oligos for Illumina

 (Index Primers Set 1) *

E7335S 24 rxns ¥21,000  最大12プレックス解析
E7335L 96 rxns ¥75,600

 NEBNext Multiplex Oligos for Illumina

 (Index Primers Set 2) *

E7500S 24 rxns ¥21,000  最大12プレックス解析
E7500L 96 rxns ¥75,600

 NEBNext Multiplex Oligos for Illumina

 (Index Primers Set 3) *

E7710S 24 rxns ¥21,000  最大12プレックス解析
E7710L 96 rxns ¥75,600

 NEBNext Multiplex Oligos for Illumina

 (Index Primers Set 4) *

E7730S 24 rxns ¥21,000  最大12プレックス解析
E7730L 96 rxns ¥75,600

 NEBNext Multiplex Oligos for Illumina 

 (96 Index Primers)

E6609S 96 rxns ¥120,000  最大96プレックス解析
E6609L 384 rxns ¥480,000

 NEBNext Multiplex Oligos for Illumina

  (Dual Index Primers Set 1) **

E7600S 96 rxns ¥86,500

 デュアルインデックス (8x12)

 最大96プレックス解析

 NEBNext Multiplex Oligos for Illumina

  (Dual Index Primers Set 2) **

E7780S 96 rxns ¥86,500

 デュアルインデックス (8x12)

 最大96プレックス解析

 NEBNext Multiplex Oligos for Illumina

  (96 Unique Dual Index Primer Pairs)

E6440S 96 rxns ¥99,000

 ユニークなインデックス配列により

 インデックス・ホッピングを低減

E6440L 384 rxns ¥356,000

 NEBNext Singleplex Oligos for Illumina

E7350S 12 rxns ¥8,500  シングルプレックス解析用
E7350L 60 rxns ¥38,000

 NEBNext Multiplex Oligos for Illumina

  (Methylated Adaptor, Index Primers Set1)

E7535S 24 rxns ¥23,500

 メチル化アダプターオリゴ

 最大12プレックス解析

E7535L 96 rxns ¥85,400
* Index Primer Set 1, 2, 3, 4 を組合せれば最大48プレックス解析が可能です。
** Dual Index Primer Set 1 と Set 2 を組合せれば 384 プレックス解析が可能です。
    アダプターオリゴの選択方法

 

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 NEBNext Library Quant Kit for Illumina
 

キット内容:

・PCR マスターミックス

・Illumina ライブラリー定量用プライマー

・4 種類の濃度のスタンダード DNA (濃度検証済み)

・ROX (2 種類の濃度)

・希釈バッファー*

製品番号 容量 希望小売価格
E7630S 100 rxns ¥ 17,800
E7630L 500 rxns ¥ 75,500
   *キット付属品とは別に単品製品 (NEBNext Library Dilution Buffer) として販売しています。
   

*Illumina®  is a registered trademark of Illumina, Inc.

*SPRIselect®  is a registered trademark of Beckman Coulter, Inc. and are registered in the USPTO.

★★★ ただいまキャンペーン実施中!詳細はこちらをご覧ください ★★★
注意:アダプターオリゴはキャンペーン対象外となっております。

NEBNext Ultra II FS DNA ライブラリー調製 製品資料 (PDFダウンロード)

英語テクニカルノート

 

本製品に関するご質問は下記テクニカルサポートまでお問い合わせください。

Tel : 0120-963-650 (フリーダイアル)、03-5669-6195

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