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10 周年:NEBNext 次世代シーケンサー用ライブラリー調製試薬
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NEBNext の販売開始から 10 年を迎えました。現在では > 6,000 の査読雑誌や各国のシーケンスセンターで使用されています。これから NGS を始める方も、すでに解析を行っている方も、今後とも NEBNext をご愛用ください!

 

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   サンプル : ゲノム DNA、ChIP-DNA、FFPE-DNA、PCR 産物、環境 DNA など

 

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ゲノム 精製 FFPE DNA 修復 Fragmentase

Ultra II + アダプター

qPCR 定量
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    Ultra II FS + アダプター  

 

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   ・ ライブラリー調製キットとアダプターが必須です
   ・ ゲノム DNA など断片化が必要な場合には、Ultra II FS キットがお薦めです
   ・ 断片化済みゲノムや ChIP-DNA、PCR アンプリコンなどは、Ultra II キットがお薦めです
   ・ NEBNext Selector で簡単に最適キットをお探しできます

 

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 ・ Monarch Genomic DNA Purification Kit
  - 幅広いサンプルから高収量でゲノム DNA を精製
   
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 ・ NEBNext FFPE DNA Repair Mix
  - FFPE 由来 DNA のダメージを修復する酵素ミックス
   
 ・ NEBNext Microbiome DNA Enrichment Kit
  - ホスト DNA よりマイクロバイオーム DNA を単離・濃縮可能
   
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 ・ NEBNext dsDNA Fragmentase
  - NGS 解析用 DNA 断片の調製に最適な DNA 断片化酵素
   
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 ・ NEBNext Ultra II DNA Library Prep Kit for Illumina

- スタンダードな DNA ライブラリー調製キット

- 断片化済み DNA や ChIP-DNA、PCR アンプリコンなどに対応
  - わずか 500 pg DNA よりライブラリーを調製
   
 ・ NEBNext Ultra II FS DNA Library Prep Kit for Illumina
  - DNA 断片化がワークフローに組み込まれた DNA ライブラリー調製キット
  - ゲノム DNA や長い PCR アンプリコンなどに対応 
  - わずか 100 pg ゲノム DNA より、簡単プロトコールでライブラリー調製
   
 ・ NEBNext Ultra DNA Library Prep Kit for Illumina(従来品)
  - 1 つ前のバージョンの DNA ライブラリー調製キット
   
 
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 スタンダードキット vs FS キット

 ・ スタンダード:あらかじめ断片化されたゲノムや、断片化の必要のない DNA からライブラリー調製をします。断片化酵素は含まれていません。

 

 ・ FS キット:インタクトなゲノム DNA など、断片化の必要がある DNA からライブラリー調製をします。断片化の必要がない DNA (ChIP-DNA や短い PCR アンプリコンなど) には使用できません。

 
 
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 酵素的断片化 (FS キット) vs 物理的断片化 (コバリスやソニケーションなど) 

 ・ FS キット:特別な機器は不要、複数サンプルを一括同時処理可能、DNA 損傷 (酸化ダメージ) が少ない点がメリットです。反面、DNA サンプルに夾雑物があった場合に断片化効率が低下する場合があり、サンプルによっては断片化サイズ調整に最適化が必要となります

 

 ・ 物理的断片化:断片化サイズの調整が容易なこと、サンプルの配列や量によらず一定のプロトコールで断片化できる点がメリットです。反面、機器や専用の消耗品が必要で、1 サンプルずつ処理しなければならず、酸化ダメージによるシーケンスエラーが導入されることがあります。
 
   
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 ・ NEBNext Multiplex Oligos for Illumina
 

- 組み合わせにより最大 384 プレックス解析が可能

 

- シングルエンド・ペアエンド解析に対応

 

- シングルインデックス、デュアルインデックスから選択可能

   
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 ・ NEBNext Library Quant Kit for Illumina
  - Illumina NGS 用ライブラリー定量キット(qPCR)
  - 定量用プライマー(P5/P7配列)、スタンダード DNA が付属
   
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 ・ NEBNext Magnetic Separation Rack
  - NGS ライブラリー調製におけるビーズ精製とセレクションに便利で強力なマグネットラック
   
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 ・ NEBNext Ultra II FS DNA Module
  - DNA 断片化とエンドプレップ(平滑化、5'リン酸化、3'A付加)のモジュール、Ultra II FS フロー用
 ・ NEBNext Ultra II End Repair/dA-tailing Module
  - エンドプレップ(平滑化、5'リン酸化、3'A付加)のモジュール、Ultra II フロー用
 ・ NEBNext Ultra II Ligation Module
  - アダプターライゲーションのモジュール、Ultra II FS と Ultra II フローで共通
 ・ NEBNext Ultra II Q5 Master Mix
  - ライブラリー増幅用ポリメラーゼ・マスターミックス、Ultra II FS と Ultra II フローで共通
 ・ NEBNext Ultra End Repair/dA-tailing Module
  エンドプレップ(平滑化、5'リン酸化、3'A付加)のモジュール、Ultra(従来品)フロー用
 ・ NEBNext Ultra Ligation Module
  アダプターライゲーションのモジュール、Ultra(従来品)フロー用
 ・ NEBNext Q5 Hot Start HiFi PCR Master Mix
  ライブラリー増幅用ポリメラーゼ・マスターミックス、Ultra(従来品)フロー用
   

DNA ライブラリー調製のワークフローおよびモジュール対応図(クリックして拡大)

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NEB TV Japan : 次世代シーケンス用ライブラリー調製 NEB TV Japan 一覧
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 NEBNext Ultra II DNA ライブラリー調製

 のプロトコール

 

 DNA インプットのヒント

 

 NEBNext EM-Seq: 新規メチル化

 シーケンスの原理と特長

 

 

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NEBNext RNA ライブラリー調製冊子 image  

 

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