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10 周年:NEBNext 次世代シーケンサー用ライブラリー調製試薬
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NEBNext の販売開始から 10 年を迎えました。現在では > 6,000 の査読雑誌や各国のシーケンスセンターで使用されています。これから NGS を始める方も、すでに解析を行っている方も、今後とも NEBNext をご愛用ください!

 

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   サンプル : トータル RNA、mRNA、rRNA-depleted RNA、RNA ウイルスゲノム など

 

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Total RNA 精製    ポリA-mRNA 精製 Ultra II Directional + アダプター qPCR 定量
  rRNA 除去 Ultra II + アダプター  

 

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 ・ 前処理試薬とライブラリー調製キット、アダプターが必須です (一部アプリケーション除く)
 ・ 解析対象の RNA と、RNA インプットの分解度などから前処理方法を選択します
 ・ ライブラリー調製は ディレクショナル (Stranded) か非ディレクショナルキットから選択します
 ・ NEBNext Selector で簡単に最適キットをお探しできます

 

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 ・ Monarch Total RNA Miniprep Kit
  - 様々なサンプルから高品質なトータル RNA を精製
   
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 ・ NEBNext Poly(A) mRNA Magnetic Isolation Module
  - マグネティックビーズにより mRNA(ポリA+RNA)を精製
   
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NEBNext rRNA Depletion Kit v2 (Human/Mouse/Rat)   New!

  - ヒト、マウス、ラットのトータル RNA から細胞質 rRNA およびミトコンドリア rRNA を除去
  - FFPE由来RNA など劣化が進行した RNA からも高効率で除去
  - オリジナルバージョン も販売継続 (#E6310)
   
 ・ NEBNext Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)
  - ヒト、マウス、ラットのトータル RNA からグロビン mRNA と rRNA を除去
  - FFPE由来RNA など劣化が進行した RNA からも高効率で除去
   
 ・ NEBNext rRNA Depletion Kit (Bacteria) New!
  - バクテリアの 5S、16S、23S rRNA を高効率で除去
  - グラム陰性菌および陽性菌に対応
   
 
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 前処理の選択方法
 ・ 生物種、解析対象、分解度などから前処理方法を選択します
 ・ 以下ガイドをご利用ください。分からない場合はテックサポートへ!
 
 
 生物種 *  解析対象 RNA  RNA の分解度  推奨の前処理キット
 ヒト・マウス・ラット  mRNA

 分解なし (RIN > 7)

 mRNA 精製キット

 (#E7490)

 mRNA **

 分解あり (RIN < 7)

 rRNA 除去キット (HMR)

 (#E7400 または #E6310)

 mRNA (グロビン mRNA 以外)

 分解度は問わない

 rRNA & グロビン mRNA 除去キット

 (#E7750)

 mRNA + ncRNA

 (small RNA 以外 ***)

 分解度は問わない

 rRNA 除去キット (HMR)

 (#E7400 または #E6310)

 真核生物  mRNA (ポリA型)

 分解なし (RIN > 7)

 mRNA 精製キット

 (#E7490)

 バクテリア

 mRNA (非ポリA型)

 分解度は問わない

 rRNA 除去キット (バクテリア)

 (#E7850)

 RNA ウイルス  ゲノムRNA  分解度は問わない

 必要なし ****

 

   * 表中に記載されていない生物種や解析対象に対応する前処理キットは、取り扱いなし (例:昆虫の rRNA 除去キット)

   ** mRNA の他、ncRNA も検出される

   *** Small RNA ライブラリー調製には #E7300 を推奨

   **** ホスト RNA が混入している場合は rRNA 除去キットなどの前処理が効果的

   
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 ・ NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep Kit for Illumina
  - ディレクショナル(Stranded)な RNA ライブラリー調製キット
  - 5 ng Total RNA よりライブラリーを調製(rRNA除去時)
   
 ・ NEBNext Ultra II RNA Library Prep Kit for Illumina

- 非ディレクショナルな RNA ライブラリー調製キット
  - 5 ng Total RNA よりライブラリーを調製(rRNA除去時)
   
 ・ NEBNext Ultra RNA Library Prep Kit for Illumina(従来品)
  - 1 つ前のバージョンの RNA ライブラリー調製キット
   
 
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 ディレクショナル vs 非ディレクショナル

 ・ ディレクショナル (Stranded) :RNA から合成された cDNA(2 本鎖)の 第 1 鎖だけからライブラリーが調製されるため、シーケンスリードは元の RNA の方向性を保っています。センス鎖、アンチセンス鎖のどちらから転写されたかを区別して解析する場合や、アッセンブルする場合に効果的です。最近の RNA シーケンスの主流です。

 

 ・ 非ディレクショナル:RNA から合成された cDNA(2 本鎖)のそれぞれからライブラリーが調製されるため、シーケンスリードは順向き/逆向きの両方が得られます。センス鎖、アンチセンス鎖の区別はできません。
 
   
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 ・ NEBNext Multiplex Oligos for Illumina
 

- 組み合わせにより最大 384 プレックス解析が可能

 

- シングルエンド・ペアエンド解析に対応

 

- シングルインデックス、デュアルインデックスから選択可能

   
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 ・ NEBNext Library Quant Kit for Illumina
  - Illumina NGS 用ライブラリー定量キット(qPCR)
  - 定量用プライマー(P5/P7 配列)、スタンダード DNA が付属
   
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 ・ NEBNext Magnetic Separation Rack
  - NGS ライブラリー調製におけるビーズ精製とセレクションに便利なマグネットラック
   
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 ・ NEBNext Ultra II RNA First Strand Synthesis Module
  - 第 1 鎖 cDNA 合成のモジュール、Ultra II (Directional) RNA フロー用
 ・ NEBNext Ultra II Non-Directional RNA Second Strand Synthesis Module
  第 2 鎖 cDNA 合成のモジュール、Ultra II RNA(非ディレクショナル)フロー用
 ・ NEBNext Ultra II Directional RNA Second Strand Synethsis Module
  - 第 2 鎖 cDNA 合成のモジュール、Ultra II Directional RNA フロー用
 ・ NEBNext Ultra II End Repair/dA-tailing Module
  - エンドプレップ(平滑化、5' リン酸化、3'A 付加)のモジュール、Ultra II (Directional) RNA フロー用
 ・ NEBNext Ultra II Ligation Module
  - アダプターライゲーションのモジュール、Ultra II (Directional) RNA フロー用
 ・ NEBNext Ultra II Q5 Master Mix
  - ライブラリー増幅用ポリメラーゼ・マスターミックス、Ultra II (Directional) RNA フロー用
   

RNA ライブラリー調製のワークフローおよびモジュール対応図 (クリックして拡大)

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NEB TV Japan : 次世代シーケンス用ライブラリー調製 NEB TV Japan 一覧
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 NEBNext Ultra II Directional RNA

 ライブラリー調製のワークフロー

 

 RNA インプットのヒント

 

 ライブラリー調製の 12 のヒント

 

 

NEBNext DNA ライブラリー調製冊子 image  NEBNext トップへ戻る
NEBNext RNA ライブラリー調製冊子 image  

 

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