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NEBNext dsDNA Fragmentase

NEBNext dsDNA Fragmentaseカタログ番号:M0348

カタログ番号

サイズ

濃度

価格(税別)

保存温度

M0348S 50 reactions ¥17,000 -20C
M0348L 250 reactions ¥68,000 -20C

製品カテゴリ>グループ

  • NEBNext次世代シーケンサー用ライブラリー調製試薬>前処理試薬

備考

  • 備考:価格改定 (2023年4月1日)

特徴

NGS解析用DNA断片の調製に最適なDNA断片化酵素

 

NEBNext dsDNA Fragmentase は NGS 解析に使用する DNA 断片の調製に最適な DNA 断片化酵素である。dsDNA Fragmentaseは2種類の酵素で構成されている酵素ミックスであり、簡単な酵素反応でゲノム DNA や PCR 産物(5 ng - 3 ug)を切断し目的サイズ(50 - 2,000 bp)に断片化することができる。切断は塩基配列に依存しないので、DNA をバイアス無しにランダムに断片化することができ、NGS 解析用DNA断片の調製に最適である。

 

特長:

・NGS解析用DNA断片の調製に最適

・ゲノムDNAやPCR産物(5 ng - 3 μg)を切断し目的サイズ(50 - 2,000 bp)に断片化
・DNAをバイアス無しにランダムに断片化
・酵素によるDNA断片化からライブラリー調製まで可能なキットも販売中(NEBNext Ultra II FS キット

 

dsDNA Fragmentaseのメカニズム
dsDNA Fragmentaseに含まれている2種類の酵素により2本鎖DNAをランダムに切断し断片化する。
image

1. Enzyme 1がランダムに片鎖を切断

2. Enzyme 2が切断箇所を認識し、相補鎖を切断(1-5 bp上流もしくは下流)

3. 断片化DNAを産生(突出末端)

 

dsDNA FragmentaseによるDNA断片化
ゲノムDNAやPCR産物を目的サイズ(50 - 2,000 bp)に断片化することができる(画像をクリックして拡大表示)。
0.1 - 1 ugのゲノムDNAを断片化 5 - 20 kbのPCR断片を断片化
image image

DNA断片のサイズはインキュベート時間により簡単に調整することができる。5 ng - 3 ugのInput DNAに対応するので、微量DNAの断片化にも最適である。

アプリケーションノート

・NEBNext dsDNA Fragmentaseを用いたDNAの断片化 (pdfダウンロード)

製品内容

・ NEBNext dsDNA Fragmentase

・ NEBNext dsDNA Fragmentase Reaction Buffer v2*

・ 200 mM MgCl2

 

*反応バッファーの組成が変更され、DNA断片化反応がより簡便かつ高感度になりました (2014年6月)。


変更点:

・反応バッファーの組成が変更 (新バッファー:Reaction Buffer v2、M0348S/Lに付属、単品販売品あり

・E.coli DNA Ligaseが不要(付属せず)

・DNAサンプルの種類によらず、プロトコールが統一化

*容量および価格に変更はありません。

関連製品

NEBNext Ultra II DNA Library Prep Kit for Illumina (イルミナ用DNAライブラリー調製キット)

NEBNext Ultra II FS DNA Library Prep Kit for Illumina (DNA断片化からライブラリー調製まで可能なキット)