NEBNext Enzymatic Methyl-seq Conversion Module
カタログ番号 |
サイズ |
濃度 |
価格(税別) |
保存温度 |
---|---|---|---|---|
E7125S | 24 rxns | ¥31,000 | -20C | |
E7125L | 96 rxns | ¥114,000 | -20C |
製品カテゴリ>グループ
- NEBNext次世代シーケンサー用ライブラリー調製試薬>Module
備考
- 備考:価格改定 (2023年4月1日)
特徴
説明:
バイサルファイトシーケンスはメチル化 DNA 解析における一般的方法であるが、バイサルファイト変換の際に DNA 損傷が起こりやすく、断片化や DNA のロス、バイアスを生じることが問題となっている。
NEB はこの問題を解決するため、酵素を使用したマイルドな条件下で非メチル化シトシンをウラシルに変換する EM-Seq 法を開発(図1)、DNA ダメージを低減して断片化やDNAのロスを低減することが可能とした。本製品は特に変換用試薬が含まれている。
特長:
• 酵素で非メチル化シトシンをウラシルに変換
• 酵素でマイルドに変換、DNA ダメージを低減
• バイサルファイト法と同じ変換パターンであるため、そのまま下流実験に移行、または解析プログラムが使用可能
• 5-mC と 5-hmC を検出
• 全ゲノムメチル化シーケンス用のライブラリー調製キット(フルキット)も販売(#E7120)
|
プロトコール
別途必要な試薬等
・DNA 断片化用機器(Covaris® S2 など) *NEBNext dsDNA Fragmentase は使用できません。
・Formamide (Sigma #F9037-100 ml) または 0.1 N NaOH
・80% エタノール など
キット内容
【変換試薬*】 |
・TET2 |
・TET2 Reaction Buffer Supplement |
・Oxidation Enhancer |
・Oxidation Supplement |
・Fe (II) Solution |
・Stop Reagent |
・APOBEC |
・APOBEC Reaction Buffer |
・BSA |
【コントロール DNA】 |
・Control DNA CpG methylated pUC19 |
・Control DNA CpG unmethylated Lambda |
技術資料
・Feature Article:Enzymatic Methyl-seq: The Next Generation of Methylome Analysis(英語)
NEB TV Japan : 次世代シーケンス用ライブラリー調製 | NEB TV Japan 一覧 | |||
EM-Seq と PBAT 法:新規メチローム解析法とその応用 2020 年 分子生物学会のオンラインセミナーです。メチローム解析分野の第一人者である九州大学 三浦先生の発表も含まれています。 |
|