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AhdI

AhdIカタログ番号:R0584

カタログ番号

サイズ

濃度

価格

保存温度

R0584S 1,000 units 10,000 units/ml ¥13,700 -20C
R0584L 5,000 units 10,000 units/ml ¥55,700 -20C

製品カテゴリ>グループ

  • 制限酵素>制限酵素

特徴

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認識配列:

Recognition

 | Isoschizomers

由来:
Aeromonas hydrophila (C. Polisson)からクローニングされたAhdI遺伝子を有するE. coli株。

 

付属試薬:

CutSmart Buffer (10X)

酵素特性および使用方法

ユニット定義:
1ユニットは、全反応容量50 μl中、37℃で1時間において、1 μgのλ DNAを消化するために必要な酵素量として定義される。

 

反応条件:

1X CutSmart Buffer

37℃でインキュベーション。

 

1X CutSmart Buffer 組成:

・50 mM Potassium Acetate
・20 mM Tris-acetate
・10 mM Magnesium Acetate
・100 μg/ml BSA
pH 7.9 @ 25°C

 

各バッファー中における活性:

NEBuffer 1.1  : 25 % 
NEBuffer 2.1  : 25 %
NEBuffer 3.1  : 10 % 
CutSmart Buffer  : 100 %

 

希釈バッファー:

Diluent A

 

保存温度:

-20℃

 

保存液組成:

・10 mM Tris-HCl
・50 mM NaCl
・1 mM DTT
・0.1 mM EDTA
・200 μg/ml BSA
・50% Glycerol
pH 7.4 @ 25°C

 

熱による不活性化:

65℃、20分間

 

メチル化感受性:

dam methylation  : 感受性なし
dcm methylation  : 感受性なし
CpG Methylation  : オーバーラップするメチル化配列の幾つかの組み合わせによって影響を受ける

 

品質管理

以下品質管理試験に基づいて各ロットが検証されている。

エキソヌクレアーゼ活性(同位体標識塩基のリリース)
  同位体標識した1本鎖DNAと2本鎖DNA、それに酵素を含む反応中において試験を実施。4時間のインキュベーションを行い、同位体標識したヌクレオチドのリリース率を決定。
   
ライゲーションおよびリカッティング
  制限酵素でDNAを過剰消化した後、T4 DNA Ligaseで再ライゲーションする割合、それにリカットできる割合をアガロース電気泳動で決定。
   
非特異的DNase活性(16時間)
  DNA基質を含む反応中において、非特異的DNAの分解を試験。16時間のインキュベーションの後、アガロースゲル電気泳動でDNAの分解が観察されないことを確認。

メモ

  1. AhdIはEam1105Iのイソシゾマーである。
  2. Ahdlは、平滑末端断片よりライゲーションが困難な1塩基3'突出末端を有するDNA断片を生成する。
  3. 哺乳類ゲノムDNAの切断は、オーバーラップするCpGメチル化のいくつかの組合わせによってブロックされる。
  4. Quick Ligation Kit(#M2200)で高効率なライゲーションを行うことができる。